SARS-CoV-2-специфичните Т-клетки са по-големи след ваксинация, отколкото след инфекция

В скорошно проучване, публикувано в Естествена микробиология списание, изследователите изследваха характеристиките на инфекцията с коронавирусна болест 2019 (COVID-19) при възстановяващи се и ваксинирани хора.

Различни проучвания съобщават за няколко аспекта на тежкия остър респираторен синдром на коронавирус 2 (SARS-CoV-2)-специфични Т-клетъчни епитопи. Необходими са обаче по-нататъшни изследвания, за да се разберат характеристиките на SARS-CoV-2-специфичните Т-клетъчни епитопни мишени чрез инфекция и чрез индуцирани от ваксина отговори.

Проучване: Репертоар от SARS-CoV-2-специфични Т-клетъчни епитопи при ваксинирани с иРНК реконвалесценти. Кредит на изображението: Shutterstock / Design_Cells

Относно изследването

В настоящото проучване изследователите оценяват специфичния за SARS-CoV-2 Т-клетъчен епитоп при реконвалесцентни индивиди, които съобщават за възстановяване от COVID-19 и лица, които са получили две и три дози месинджър рибонуклеинова киселина SARS-CoV-2 Pfizer/BioNTech (mRNA ) ваксина.

Екипът първо картографира глобалния SARS-CoV-2-специфичен CD8 отговор+ Т-клетъчен отговор срещу човешки левкоцитен антиген (HLA)-ограничени CD8+ Т-клетъчни епитопи в специфични за епитопа Т-клетъчни култури. След това върху културите се извършва оцветяване с интерферон-γ (IFN-γ). Екипът също така сравнява вирусните последователности на дивия тип (WT) B и Omicron (B.1.1.529) SARS-CoV-2 варианти.

За оценка на степента на CD8+ Т-клетъчните отговори сред възстановяващите се срещу ваксинираните хора, екипът разгледа припокриващите се пептиди (OLPs), присъстващи в шиповия протеин на SARS-CoV-2. За всички CD8 положителни+ Т-клетъчните отговори, изследователите оценяват OLP за оптималните HLA-ограничени епитопи, експресирани от всеки участник. Екипът проведе и а силикон анализ, който прогнозира най-вероятната HLA рестрикция и оптимален епитоп. CD4+ Т-клетъчните отговори също бяха анализирани с помощта на OLP, които покриваха протеин S.

След това екипът оценява въздействието на Т-клетъчните отговори, предизвикани от бустерната ваксина или инфекцията върху S-специфичния CD8+ Т-клетъчни отговори, използващи припокриващи се S пептиди, които картографират S-специфичен CD4+ и CD8+ Т-клетъчни отговори при трикратно ваксинирани хора, както и при реконвалесценти, които са получили бустер доза иРНК. Наблюдаваният S-специфичен CD8+ Т-клетъчните отговори след ваксинация с тРНК бяха анализирани с помощта на Т-клетъчни отговори, насочени към силно запазени региони в SARS-CoV-2 при ваксинирани и възстановяващи се индивиди.

Резултати

Резултатите от проучването показаха, че CD8+ Т-клетъчните отговори сред възстановяващите се участници са насочени към повечето от SARS-CoV-2-специфичните епитопи, присъстващи във вирусния протеин. По-специално, при ваксинирани индивиди, CD8+ Т-клетъчните отговори бяха насочени срещу епитопи на SARS-CoV-2 spike (S). Освен това някои от CD8+ Т-клетъчните отговори са насочени към не-S епитопи, докато HLA-B*07/N епитопът е основната цел.

Индивидуален S-специфичен CD8+ Т-клетъчните отговори са по-склонни да бъдат насочени при ваксинирани хора, отколкото при реконвалесцентни хора. В допълнение, S-специфичен CD8+ Т-клетъчните отговори са по-широки при ваксинираните хора, отколкото при реконвалесцентите. Чрез сравняване на вирусни последователности, присъстващи в SARS-CoV-2 WT и щамове Omicron, екипът наблюдава, че само един оптимален CD8+ Т клетъчен епитоп е засегнат от вариации на вирусна последователност в подвариантите на Omicron BA.1 и BA.2.

a,b, брой, местоположение и проценти на специфични за spike CD8+ и CD4+ Т клетъчни отговори към OLPs, които могат да бъдат открити при ваксинирани срещу SARS-CoV-2 след втората спрямо третата доза иРНК ваксина Pfizer/ BioNTech (bnt162b2, измерено 2-4 седмици след ваксинация) (a) и при лица, възстановяващи се от SARS-CoV-2, които впоследствие са получили единична бустер доза Pfizer/BioNTech mRNA (bnt162b2, измерена 2 седмици след ваксинация). имунизация) (b).  Всяка топлинна карта представлява данни от представително лице.  Насочените епитопи с вариации на последователността в Omicron/B.1.1.529, BA.1 са маркирани в червено.  c, d, Показани са ваксинирани и реконвалесценти с CD8+ (c) и CD4+ (d) Т клетъчни отговори вътре и извън високо консервативните селективни сканиращи региони в шиповия протеин.  Статистическият анализ беше извършен с подписан двустранен сдвоен тест на Wilcoxon.а,бСпецифичен за пика брой CD8, местоположение и проценти+ и CD4+ Т-клетъчни отговори на LPO, които се откриват при ваксинирани срещу SARS-CoV-2 след втората спрямо третата доза mRNA ваксина Pfizer/BioNTech (bnt162b2, измерена 2–4 седмици след ваксинацията) (а) и при лица, възстановяващи се от SARS-CoV-2, които впоследствие са получили единична бустер доза Pfizer/BioNTech mRNA (bnt162b2, измерена 2 седмици след ваксинацията) (б). Всяка топлинна карта представлява данни от представително лице. Насочените епитопи с вариации на последователността в Omicron/B.1.1.529, BA.1 са маркирани в червено. срещу,дВаксинирани и реконвалесцентни хора с CD8+ (срещу) и CD4+ (д) Показани са Т-клетъчните отговори вътре и извън силно запазените селективни сканиращи региони в шиповия протеин. Статистическият анализ беше извършен с подписан двустранен сдвоен тест на Wilcoxon.

При реконвалесценти нито един от алелите на HLA клас I не показва ограничаване на повече от два S-специфични CD8.+ Т-клетъчни отговори, докато при ваксинираните индивиди множество HLA алела ограничават най-малко пет специфични CD8S+ Т-клетъчни отговори Освен това, повече S-специфични CD8+ Т-клетъчните отговори са наблюдавани на ваксинирано лице в сравнение с реконвалесцентите. Това показва най-голямата степен на CD8+ Т-клетъчни отговори във ваксинираната кохорта.

Екипът също така забеляза, че S-специфичен CD4+ Т-клетъчните отговори бяха по-ограничени след ваксинация, отколкото след инфекция със SARS-CoV-2. По-специално, по-нисък S-специфичен брой CD4+ Т-клетъчните отговори са ограничени от HLA алели, докато по-малко CD4+ Т-клетъчните отговори са открити при ваксинирани индивиди в сравнение с реконвалесцентни индивиди.

CD4+ и CD8+ S-специфичните Т-клетъчни отговори са сравнително по-стабилни във времето при ваксинирани, както и при реконвалесцентни индивиди. По-специално, няколко S-специфични CD4+ Т-клетъчните отговори, наблюдавани при ваксинирани индивиди, показват висока консервация между SARS-CoV-2 WT и Omicron BA.1 и BA.2 варианти. Освен това, ваксинацията с иРНК също повишава CD8+ Т клетъчни отговори, насочени към запазени S-специфични епитопи.

Екипът забеляза, че избрани региони за сканиране в SARS-CoV-2 показват силна аминокиселинна хомология сред нововъзникващите опасни варианти на SARS-CoV-2. Пълна хомология е открита във варианта на SARS-CoV-2 Delta, една точкова мутация е открита във вариантите Alpha или Beta, две мутации във варианта Gamma, седем точкови мутации във варианта Omicron BA.1 и девет точкови мутации в Omicron Вариант BA.2. В допълнение, S-специфичен CD8+ Т-клетъчните отговори са открити повече при реконвалесцентни индивиди, отколкото при ваксинираната популация.

Като цяло резултатите от проучването подчертават значението на индуцираната от ваксина SARS-CoV-2 специфична CD8 S иРНК+ S-специфични Т-клетъчни отговори срещу инфекции и прогресия на заболяването на опасни варианти на SARS-CoV-2.

.

Add Comment